Paulo Estudante es doctor en Historia de la Música y Musicología por la Université Paris IV-Sorbonne y la Universidade de Évora, obteniendo también de la primera la licenciatura y el Diplôme d’Etudes Approfondies (DEA) en Musicología. Tras trabajar con los profesores Filipe Nabucco-Silvestre y Ana Mafalda Castro prosiguió sus estudios de clave, música de cámara y bajo continuo en París con el profesor Ilton Wjuniski. Es también licenciado en Matemática Aplicada à Ciência dos Computadores por la Universidade do Porto.

En la actualidad es profesor de la Universidade de Coimbra y miembro del Centro de Estudos Clássicos e Humanísticos de la misma donde, junto a José Abreu, coordina el proyecto Mundos e Fundos | Mundos Metodológicos e Interpretativos dos Fundos Musicais. Desarrolla trabajos de investigación en las áreas de filología musical y edición crítica del patrimonio musical portugués anterior al siglo XIX, con particular interés en los fondos conservados hoy en la Biblioteca Geral de la Universidade de Coimbra.