José Abreu es diplomado en flauta por el Conservatorio de Música de Oporto y doctor en Musicología por la Universidad de Surrey, Reino Unido. Es miembro integrado del Centro de Estudios Clásicos y Humanísticos (CECH) de la Universidad de Coimbra, donde ha desarrollado y supervisado múltiples proyectos de investigación sobre fuentes musicales de los siglos XVI al XVIII conservadas en archivos y bibliotecas portuguesas. Junto con Paulo Estudante, creó el proyecto Mundos e Fundos | Mundos Metodológicos e Interpretativos dos Fundos Musicais. También es miembro del grupo internacional de investigación Lexique Musical de la Renaissance, con sede en el Centre d’Études Supèrieures de la Renaissance (Tours, Francia) y del proyecto Tratados musicales en español, con sede en la Universidad de Salamanca. Imparte clases en el Conservatorio de Música de Aveiro, en la Universidad de Coimbra (posgrado en Estudios Artísticos) y ha colaborado con la Escola Superior de Música e Artes do Espectáculo de Oporto. Su campo de investigación se centra en el patrimonio musical portugués anterior al siglo XVIII, sus principales intereses son el estudio de las fuentes musicales, el contrapunto y la reconstrucción musical, los procesos y técnicas compositivas, la contextualización social y cultural de la práctica musical europea y la edición crítica de la música de este periodo.